La microbiologia è la branca della Biologia che studia i microrganismi, con particolare attenzione alle loro caratteristiche fisiche-chimiche, alla loro classificazione e all’interazione che hanno l’uno con l’altro e nei confronti dell’ambiente.
Batteri, virus, funghi e protozoi possono essere coltivati; si utilizzano dei terreni di coltura, particolari miscele di diverse sostanze in grado di apportare il nutrimento necessario alle colonie di microrganismi in accrescimento. Mentre i batteri ed i funghi crescono su terreni relativamente semplici, come brodi o gelatine, i virus necessitano di colture cellulari, piastre che contengono cellule umane o animali in grado di fornire gli apparati replicativi ed energetici di cui i virus hanno bisogno. Questi terreni sono molto importanti perché, in base alle preferenze “alimentari” di alcuni batteri, si riesce a riconoscere il genere e talora la specie di cui fanno parte. Un esempio è la capacità che hanno alcuni batteri di crescere in terreni arricchiti con bile (Enterobacteriaceae), con sale (Staphylococcus) o tellurito (Corynebacterium).
Ricerche frequenti in microbiologia riguardano patogeni quali E.coli, Salmonella spp., Shigella spp., Klebsiella spp., Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa, Stafilococcus aureus, Streptococcus agalactie, Candida albicans, Micoplasma hominis, Ureaplasma urealiticum, Gardnerella vaginalis, Trichomonas vaginalis, etc. Tali patogeni, a seconda del loro habitat naturale, possono essere ricercati in vari tipi di campioni quali: urine, feci, sangue, tampone rino-faringeo, tampone vaginale, tampone auricolare, tampone oculare.